Riepilogo rapido
já que = poiché, dato che (introduce la causa)
por isso = per questo, perciò (conseguenza, tono informale)
portanto = pertanto, dunque (conseguenza, tono formale)
Já que: all’inizio o al centro della frase
Por isso: di solito dopo una virgola
Portanto: posizione flessibile, spesso più formale
Direzione logica: já que→risultato oppure causa→por isso
Registro: por isso < portanto